In Crossing Lines geht es um die Entstehung einer Eliteeinheit, die vom internationalen Strafgerichtshof ins Leben gerufen wird. Ihr Auftrag lautet, grenzübergreifende Serienverbrechen zu ermitteln und die Täter vor Gericht zu bringen. Die Zentrale des Teams ist untergebracht in einem leerstehenden Lagerraum unterhalb des Internationalen Strafgerichtshof von Den Haag. Das ungleiche Team wird mit den bürokratischen, juristischen und kulturellen Barrieren konfrontiert, während es gegen die Verbrechen der gefährlichsten und brutalsten Verbrecher der Welt agiert.